Początkowo film miał wyreżyserować Adrian Lyne.
Kiedy karetka uderza w centrum dowodzenia FBI, wzdłuż ulicy widoczne są kable służące do odciągnięcia ciężarówki.
Kiedy Doug bije wandali, którzy zdewastowali samochód Claire, drzwi ich mieszkania zmieniają się z zamkniętych na otwarte, a potem znowu na zamknięte.
W jednej ze scen Doug MacRay rozmawia ze swoim ojcem przez szybę w więzieniu. Jedno z ujęć koncentrujących się na Dougu ukazuje odbicie twarzy starszego MacRay'a z ustami poruszającymi się, mimo że w tym momencie żaden z rozmówców się nie odzywa.
Podczas gdy gang przygotowuje się do rabunku Fenway Park po meczu Red Sox-Yankees, telewizja pokazuje mecz pomiędzy Red Sox i Toronto.
Po drugim skoku, kiedy złodzieje zatrzymują się by zamienić samochody, wyraźnie widać, że po drugiej stronie drogi nie ma radiowozu i koparki. Jednak gdy tylko wychodzą ze swojego samochodu, radiowóz i koparka pojawiają się.
W scenie napadu na Fenway Park mozna zauważyć, że jeden z samochodów bostońskiej policji ma tablice rejestracyjne z New Jersey.
Kiedy Doug prosi Claire o wspólny wyjazd z miasta, wypowiadane przez niego słowa nie pasują do ruchu warg.
Podczas napadu w Fenway, ubrany w mundur policjanta Ben Affleck jest nieogolony, ale kiedy zaczyna ucieczkę jako pracownik służb ratowniczych zarost znika.
Podczas ostatniego skoku, kiedy Coughlin zostaje zabity, na jego twarzy pojawiają się dwie rany postrzałowe, mimo że słychać było tylko jeden strzał.
Podczas napadu na bank Cambridge, nagranie wideo z kamery znajdującej się przy drzwiach, pokazuje datę 16 czerwca 2010 roku. Jednak w widocznym w późniejszej scenie raporcie, FBI pisze, że do napadu doszło we wrześniu 2011 roku.
Kiedy Gloansy ucieka karetką z miejsca napadu, Frawley strzela i trafia w lewą tylną opnę pojazdu. Jednak gdy karetka uderza furgonetkę SWAT możemy zauważyć, że opona jest w stanie nienaruszonym.
Kiedy agent specjalny Frawley przegląda akta sprawy Claire Keesey, możemy dostrzec, że według raportu zbrodnia miała miejsce we wrześniu 2011 roku. Pisze tam też, że Keesey urodziła się 19 maja 1978 roku i ma 30 lat. Jednak skoro napad odbył we wrześniu 2011 roku, Claire powinna mieć 33 lata.
Kiedy Doug i Claire odwiedzają asystenta dyrektora banku w szpitalu, mężczyzna mówi "I just want to get back to work". Jednak w ujęciu z przeciwnej strony możemy zauważyć, że usta mężczyzny nie poruszają się, ale słyszymy wypowiadane przez niego słowa.
W filmie zostaje powiedziane, że Stephen MacRay siedzi w więzieniu za zabójstwo dwóch strażników opancerzonej furgonetki na terenie stanu New Hampshire. Mimo to swój wyrok odsiaduje w więzieniu stanowym w Massachusetts.
Podczas sceny w kwiaciarni na drugiej stronie ulicy możemy zauważyć bar o nazwie "Fitzgerald's". Jednak w jednej z późniejszych scen widzimy ten sam bar, ale na szyldzie znajduje się napis "The Junction", czyli nazwa prawdziwego baru w południowym Bostonie, gdzie kręcono zdjęcia do filmu.
Zdjęcia do filmu kręcono w Bostonie, Melrose i Somerville (Massachusetts, USA) oraz w Uncasville (Connecticut, USA).
Zdjęcia do filmu rozpoczęły się we wrześniu 2009 roku.
Początkowa wersja filmu, którą Ben Affleck zaprezentował producentom, trwała ponad cztery godziny. Kiedy zdał sobie sprawę, że taki film nigdy nie trafiłby do szerokiej publiczności, w trzy dni skrócił go do 2 godzin i 50 minut. Producenci przyjęli tą wersję, lecz dalej uważali, że jest zbyt długa. Affleck i producent Basil Iwanyk zmuszeni byli dalej kaleczyć materiał, ponieważ studio oczekiwało filmu nie dłuższego niż 2 godziny i 10 minut. Ostatecznie reżyser skrócił film do 2 godzin i 8 minut, przycinając sekwencje akcji, rozwój postaci i dialogi. Pomimo chwilowego zadowolenia z wersji kinowej, Affleck wydał na DVD i Blu-Ray wersję rozszerzoną zawierającą wycięte sceny. Powiedział też, że o ile kinowe "Miasto złodziei" jest wierną adaptacją powieści "Prince of Thieves", to wersja rozszerzona stanowi jej lustrzane odbicie.
Studio chciało, by film zakończył się podobnie jak książka, czyli znacznie mroczniej. Zakończenie, w którym Doug zostaje śmiertelnie raniony po strzelaninie z Fergiem i w końcu umiera w ramionach Claire w jej apartamencie, zostało nakręcone, jednak publiczność podczas pokazów testowych zaakceptowała to, w którym główny bohater przeżyje.
Reżyser i gwiazda filmu - Ben Affleck najbardziej obawiał się tego, iż aktorzy nie będą brzmieć z typowym bostońskim akcentem. Kiedy podczas przesłuchania Blake Lively czytała swoje kwestie, brzmiała tak autentycznie, że Affleck zapytał się jej w której części Bostonu się wychowała. Tak naprawdę Lively urodziła się i dorastała w Kalifornii (USA).
Ben Affleck poprosił Blake Lively, by w ramach przygotowań do swojej roli dobrze poznała mieszkańców Charlestown. Aktorka spędziła więc miesiąc zadając się z nimi oraz odwiedzając ich mieszkania i bary.